Отношения с Дальневосточными регионами Российской Федерации поддерживаются с давних пор, однако, в последние годы, с переходом России к демократическому обществу, связи с Дальним Востоком в области экономики, культуры, науки, спорта и др. приобрели более постоянный характер.
С установлением в 1966 г. побратимских связей между городами Отару и Находка, количество городов-побратимов среди муниципальных образований Хоккайдо и Дальневосточных регионов РФ достигло в наши дни 18. В сентябре 2001 г. состоялось заключение побратимских отношений между г.Вакканай и г.Южно-Сахалинском. Принимая во внимание большое количество муниципальных образований, осуществляющих обмены в рамках побратимского сотрудничества, и другие связи, Губернаторство Хоккайдо в 1996 г. учредило "Совет дружеских обменов между городами Хоккайдо и России" и прилагает усилия к созданию информационной сети между Губернаторством Хоккайдо и муниципальными образованиями, а также между самими муниципальными образованиями.
В настоящее время наблюдается развитие связей между различными обществами, организациями двух регионов. Мы надеемся, что Хоккайдо и впредь, используя свое выгодное географическое положение, будет активно углублять контакты с Дальним Востоком России.
В июне 1990 г. делегация Хоккайдо по приглашению Совета министров РСФСР посетила Москву и регионы Дальнего Востока. Во время визита была достигнута договоренность о развитии взаимного сотрудничества между Хоккайдо и Россией в экономике и во многих других областях. Основываясь на данном соглашении, в сентябре 1992 г. была создана "Постоянная смешанная комиссия по экономическому сотрудничеству между Хоккайдо и Дальневосточными регионами России", а также принята "Программа экономического сотрудничества между Хоккайдо и Дальним Востоком России". Данная Программа экономического сотрудничества, взяв за основу взаимное сотрудничество между Хоккайдо и регионами Дальнего Востока - Приморским, Хабаровским краем и Сахалинской областью, содержит меры, предпринимаемые администрациями Хоккайдо и регионов Дальнего Востока по ускорению экономического сотрудничества, а также включает в себя пункты для реализации сторонами программы в течение 5 лет. По истечении 5 лет с момента принятия данной программы, в сентябре 1997 года была подписана вторая по счету Программа экономического сотрудничества.
В настоящее время, на основе второй Программы экономического сотрудничества осуществляется деятельность по обмену кадрами среди руководителей предприятий и административных работников, а также по техническому обмену в области сельского хозяйства, лесной промышленности, рыбной отрасли, а также в области совершенствования инфраструктуры. Осуществляется сотрудничество по налаживанию и совершенствованию транпортной системы: паромной переправы, авиалиний и др.Также стороны ведут сотрудничество в реализации нефтегазовых проектов Сахалинского континенттального шельфа, в установлении компьютерной промышленно-экономической информационной системы.
В сентябре 2002 года исполнилось 5 лет со дня принятия второй Программы экономического сотрудничества и на данном этапе проводятся консультации с Россией относительно разработки новой Программы экономического сотрудничества.